Taller de bioquímica computacional para el análisis de proteínas y compuestos bioactivos

El diseño de fármacos basado en la estructura de una proteína blanco es una herramienta poderosa en la que confluyen varías disciplinas científicas. Una visión simplista pero descriptiva de este enfoque es que la conformación de una proteína puede modularse, y por tanto su actividad biológica también, a través de la unión de moléculas pequeñas en determinados sitios de su superficie. El reto es encontrar moléculas con el tamaño, geometría, composición y orientación adecuadas para unirse con suficiente afinidad y especificidad a dichos sitios. Una vez seleccionado un blanco farmacológico, debemos buscar entonces moléculas que se unan a sitios clave de su superficie para modificar su actividad biológica. Nuestra intención con este manual es que las personas que realicen los ejercicios aquí contenidos conozcan y se familiaricen con algunos procedimientos y programas de libre acceso comúnmente utilizados en el campo, para que puedan aplicarlos posteriormente a cualquier proteína blanco en particular.

Ustedes verán como partiendo solo de la secuencia de aminoácidos de la proteína blanco seleccionada, es posible proponer después de una serie de procedimientos una lista de moléculas orgánicas como posibles candidatos a unirse y modificar la actividad biológica de dicho blanco.

Al realizar este taller cada uno de los participantes deberá llevar un registro de las actividades realizadas durante todo el proceso. Particularmente hemos resaltado en fondo gris una serie de preguntas y actividades que deberán responder y registrar para su posterior evaluación.

Confiamos en que este manual pueda guiarlos y motivarlos a adentrarse al interesante mundo del Diseño de Fármacos.